二代健保修法改採扣取補充保險費之摘要
行政院衛生署 101年4月3日
一.為了推動健保改革，行政院特別於90年7月間成立二代健保規劃小組，經數年的規劃，提出總結報告，衛生署乃依據該項報告，研提二代健保修法草案，由行政院於95年5月首次將法案送立法院審議，97年2月因為立委任期屆期，再次送立法院審議。
二、99年4月，衛生署因考量社會變遷，經檢討後重新提出修正草案，陳報行政院於99年4月8日送立法院審議，經交付委員會審查，在審查法案過程中，有關「家戶總所得」新制核心之條文，多遭保留，後經黨團協商，仍然沒有共識，執政黨立法院黨團，於是提出修正動議，改以「補充保險費」取代相關之條文，全案於100年1月4日三讀通過，並且經總統於1月26日公布。
三、在黨團協商前，衛生署持續就「家戶總所得」新制之版本，對外溝通加強說明，經過召開1次專家學者座談、6場次溝通說明會，並且多次出席立委召開之公聽會，極力爭取各界支持，可惜始終無法形成共識，甚至引發「虛擬所得」、「懲罰單身」等嚴厲之批評，指稱家戶總所得之保費新制，係架構在所得稅制度下，且多仰賴事後結算，財源不確定性較高，讓健保之營運，增加許多風險。
四、後來，多位立委乃建議在維持二代健保擴大費基、提升負擔公平之精神前提下，保費計收部分，維持現有方式，但將外界普遍認為應該納入保險費計收之高額獎金、執行業務收入、股利所得、利息所得、租金收入及兼職所得等，增列為計費基礎，收取補充保險費，並且採取「就源扣繳」、「免除事後結算」方式簡化收繳流程，以避免跨年度還必須向民眾追繳保險費之情形。
五、前開擴大費基方式，雖有未盡完美之處，但計收補充保險費之後，保費計算基礎，其實已涵蓋了保險對象大約90%的綜合所得，較現制確實已朝更公平、更合理的方向改革；未來配合稅制改革，仍可逐步朝向更理想的方向邁進。而家戶總所得計費制度，也將列入未來三代健保改革方向之一。
六、目前，衛生署及健保局正全力辦理實施二代健保之籌備工作中，各界所關心37項法規增修作業，將分波陸續於4月、5月、6月完成研議，整體籌備工作也都會在101年6月，依照原訂規劃，完成準備工作。